केंद्रीय विद्यालय सी.सु.ब. अरधपुर का शुभारंभ वर्ष 2011 में प्राथमिक कक्षाओं (कक्षा 1 से 5) के साथ हुआ था। प्रारंभ में यह विद्यालय पश्चिम बंगाल के मालदा ज़िले के नारायणपुर स्थित 88वीं बटालियन सी.सु.ब. (BSF) परिसर के एक अस्थायी भवन में संचालित हो रहा था। वर्ष 2016 से विद्यालय का विस्तार करते हुए कक्षा 10वीं तक का अध्यापन प्रारंभ किया गया।
विद्यालय प्रशासन, विद्यालय प्रबंध समिति और केंद्रीय विद्यालय संगठन (क्षेत्रीय कार्यालय, कोलकाता) के निरंतर प्रयासों के परिणामस्वरूप जून 2026 में विद्यालय को एक स्थायी भवन प्राप्त हुआ। तदोपरांत, 17 जून 2026 को विद्यालय आधिकारिक रूप से इस नए भवन में स्थानांतरित हो गया।
27 अगस्त 2026 को भारत सरकार के शिक्षा एवं पूर्वोत्तर क्षेत्र विकास राज्य मंत्री, डॉ. सुकांत मजूमदार द्वारा इस नवीन भवन का विधिवत उद्घाटन किया गया। यह उपलब्धि विद्यालय की विकास-यात्रा में एक ऐतिहासिक मील का पत्थर सिद्ध हुई है। एक साधारण शुरुआत से अग्रसर होकर, यह विद्यालय अब अपने स्थायी परिसर में सीमा सुरक्षा बल (BSF) के कार्मिकों के बच्चों एवं स्थानीय विद्यार्थियों को गुणवत्तापूर्ण शिक्षा प्रदान कर रहा है।